महावीर पुन केवल वैज्ञानिक, शिक्षक र सामाजिक उद्यमी मात्र होइनन्, उनी हाल नेपाल सरकारमा शिक्षा, विज्ञान र प्रविधि मन्त्रीको रूपमा सेवा गरिरहेका छन्। यो भूमिका उनले आफ्नो सम्पूर्ण अनुभव, अनुसन्धान र नवप्रवर्तन परियोजनालाई राष्ट्रिय स्तरमा कार्यान्वयन गर्ने अवसरको रूपमा ग्रहण गरेका छन्। उनको कार्यक्षेत्रमा शिक्षा सुधार, विज्ञान र प्रविधिको प्रवर्द्धन, डिजिटल पहुँच विस्तार र नवप्रवर्तनलाई राष्ट्रिय नीति निर्माणसँग जोड्ने मुख्य उद्देश्य छन्।
मन्त्रीको रूपमा महावीरले नेपालका दुर्गम क्षेत्रसम्म शिक्षा, स्वास्थ्य र डिजिटल पहुँच पुर्याउन जोड दिएका छन्। उनी प्रविधि र शिक्षा प्रणालीलाई सुदृढ बनाउन सक्रिय छन्। यस भूमिकामा उनले केवल योजना बनाउनु मात्र होइन, कार्यान्वयन र अनुगमनको जिम्मेवारी पनि लिएका छन्। उनको दृष्टिकोणमा शिक्षा र प्रविधि समान रूपले सबै नागरिकका लागि पहुँचयोग्य हुनु अत्यावश्यक छ।
साथै, मन्त्रीको रूपमा उनले अन्तर्राष्ट्रिय सहयोग र प्रविधि साझेदारीलाई नेपालमा ल्याउन विशेष ध्यान दिएका छन्। युवा वैज्ञानिक र अनुसन्धानकर्तालाई प्रोत्साहन, नवप्रवर्तन परियोजनालाई राष्ट्रिय नीति र बजेटमा समावेश गराउने, र ग्रामीण समाजमा प्रविधि आधारित कार्यक्रम लागू गर्ने उनका प्रयासहरू निरन्तर जारी छन्। यसले उनलाई केवल राष्ट्रिय स्तरमा मात्र होइन, अन्तर्राष्ट्रिय स्तरमा पनि सम्मानित बनाएको छ।