कृष्ण प्रसाद सिटौलाको राजनीतिक यात्रा नेपाली कांग्रेस पार्टीसँग जोडिएको छ, जुन नेपालको सबैभन्दा पुरानो र प्रभावशाली राजनीतिक दलहरूमध्ये एक हो। उनले पार्टीमा सक्रिय भएर काम गर्दै राजनीतिक नेतृत्वमा आफ्नो स्थान बनाएका छन्। नेपाली कांग्रेसका पूर्व अध्यक्ष सुषिल कोइरालाले उनलाई पार्टीको महासचिव पदमा मनोनित गरेर पार्टीभित्रको विश्वास र सम्मान प्रकट गरेका थिए। सिटौला कोइराला परिवारका नजिकका सहयोगी र सल्लाहकार मानिन्छन्, जसले उनलाई पार्टीको महत्वपूर्ण निर्णयहरूमा प्रभावशाली भूमिका निभाउन अवसर दिएको छ।
सन् २००६ मा, सिटौलाले नेपालको गृह मन्त्रालयको जिम्मेवारी पाएका थिए, जुन देशको आन्तरिक सुरक्षा, प्रशासनिक स्थिरता र राजनीतिक प्रक्रियामा महत्वपूर्ण भूमिका हो। त्यही वर्ष उनी उपप्रधानमन्त्री पनि बने, जुन पदले उनको राजनीतिक क्यारियरमा नयाँ उचाई ल्यायो। त्यतिबेला नेपालमा माओवादी विद्रोहपछि शान्ति प्रक्रिया सुरु भइरहेको थियो र गृह मन्त्रीको रुपमा उनको जिम्मेवारी अत्यन्त संवेदनशील थियो। उनले शान्ति सम्झौताका लागि आवश्यक रणनीति बनाउने र लागू गर्ने कार्यमा नेतृत्व दिएका थिए।
सिटौलाले पहिलो पटक १९९४ मा झापा-१ निर्वाचन क्षेत्रबाट उपनिर्वाचनमा जीत हासिल गरेका थिए र १९९९ मा त्यही स्थानबाट पुनः निर्वाचित भएका थिए। त्यसपछि उनी दोस्रो संविधानसभाको निर्वाचनमा झापा-३ क्षेत्रबाट निर्वाचित भई संसदमा पुगे। यी चुनावहरूमा उनले आफ्नो क्षेत्रमा जनताको विश्वास जित्न सफल भएका थिए, जसले उनको नेतृत्व र कामप्रति जनताको सन्तुष्टि देखाउँछ।
तर २०१७ को चुनावमा उनको राजनीतिक यात्रामा ठूलो चुनौती आयो। राष्ट्रिय प्रजातन्त्र पार्टी (RPP) ले नेपाली कांग्रेससँग गठबन्धन गरेर राजेन्द्र प्रसाद लिङ्देनलाई अघि सारेको थियो, जसले निर्वाचनमा सिटौलालाई पराजित गरायो। त्यसैगरी, नेकपा (एकीकृत समाजवादी) सँग मिलेर गठबन्धनले सिटौलाको साख कमजोर पार्न ठूलो भूमिका खेलेको विश्लेषण गरिन्छ। यस घटनाले नेपाली राजनीतिमा गठबन्धन र राजनीतिक रणनीतिका महत्वलाई पुनः पुष्टि गर्यो।