कछुवाहरूले युगौँसम्मको परिवर्तनलाई सामना गरेका छन् भने पनि, आधुनिक मानव गतिविधिहरू अनपेक्षित खतरा निम्त्याउँदैछन्। धेरै प्रजातिहरू, जस्तै मेडागास्करका रेडिएटेड र प्लाउशेयर कछुवा, "गम्भीर रूपमा संकटमा" सूचीबद्ध छन्, जसको कारण आवास विनाश, पालतू व्यापारको लागि गैरकानूनी सङ्ग्रह, र खाद्य वा पारम्परिक औषधिका लागि अधिक सङ्कलन हो। वन्यजीव जनसंख्या घट्दै छ, र केही प्रजातिहरू विलुप्तिको नजिक छन्।
अर्का प्रजातिहरू, जस्तै दक्षिणपूर्वी संयुक्त राज्य अमेरिकाका गोफर कछुवा, "संकटमा" सूचीबद्ध छन्। तिनीहरूका आन्तरिक महत्त्वभन्दा बाहेक, यी जनावरहरूले तिनीहरूको पारिस्थितिकीय प्रणालीमा महत्त्वपूर्ण भूमिका निभाउँछन्। उदाहरणका लागि, गोफर कछुवा एउटा प्रमुख प्रजाति हो जसका गुफाले सयौं अन्य जनावरहरूको लागि आश्रय प्रदान गर्छ, जसले जीवनका आपसी सम्बन्धहरूको महत्त्वलाई प्रमाणित गर्दछ।
कछुवाहरूको संरक्षणका प्रयासहरूमा पालतू प्रजनन कार्यक्रमहरू, आवास पुनर्स्थापना, र गैरकानूनी शिकार विरोधी कानूनी कार्यान्वयन समावेश छन्। संरक्षित क्षेत्रहरू र पुनःप्रवर्तन परियोजनाहरूले सुधारको आशा प्रदान गर्छ, यद्यपि धीमी प्रजनन दरहरूले घट्दो जनसंख्यालाई पुनर्निर्माण गर्नका प्रयासहरूलाई जटिल बनाउँछ।