दक्षिण सुडान विश्वका अति गरिब र कम विकसित राष्ट्रहरू मध्ये एक हो, जहाँ करिब ८०% जनसंख्या कृषि वा पशुपालनमा निर्भर छ। २०१३ मा सुरु भएको गृहयुद्धले अर्थतन्त्रमा गम्भीर असर पुर्याएको छ। यहाँको कृषि परम्परागत वर्षा-आधारित खेती द्वारा सञ्चालित छ, जहाँ प्रमुख बाली जौँ (sorghum) हो। अन्य बालीनालीहरूमा मकै, कोदो, चामल, कसाभा, भुइँकटहर, गुलियो आलु, ओकरा, र कफी पर्दछन्।
भुइँकटहर (peanuts) मुख्य नगदे बाली हो, भने बाख्रा, भेडा, र गाईवस्तु प्रमुख पशुपालन क्षेत्रमा पर्दछन्। तर, पशुपालन उद्योग निर्यातका लागि अझै अपरिपक्व छ। वन क्षेत्रहरूबाट माहोगनी (mahogany) र सान्त (sant) जस्ता काठ, नरमकाठ (softwoods), र गम अरविक (gum arabic) प्राप्त हुन्छ, जुन एक महत्वपूर्ण कृषिजन्य निर्यात हो।
खानी तथा खनिज स्रोतहरूमा सबैभन्दा महत्वपूर्ण पेट्रोलियम हो, जसको खोज १९७० को अन्त्यतिर गरिएको थियो। तर, गृहयुद्धका कारण यसको व्यावसायिक उत्खनन २०औँ शताब्दीको अन्त्यसम्म सम्भव भएन। अन्य खनिज स्रोतहरूमा मार्बल, माइका, र युरेनियम पर्दछन्।
देशभर विद्युत् पहुँच निकै सीमित छ, विशेष गरी ग्रामीण क्षेत्रमा। धेरैजसो जनसंख्या इन्धनको लागि दाउरा वा कोइला मा निर्भर छ। जलविद्युत् सम्भावना भए पनि, हालसम्म यसको प्रयोग न्यून छ।
उद्योग क्षेत्र कमजोर छ, जसमा गृहयुद्ध, जनशक्ति अभाव, र कच्चा पदार्थको अभावले समस्या ल्याएको छ। स्थानिय रूपमा बियर, सफ्ट ड्रिंक्स, चिनी, तथा अन्य खाद्य पदार्थहरू उत्पादन गरिन्छन्। निर्माण उद्योग आधारभूत पूर्वाधारको माग बढ्दै गएको कारण विस्तार भइरहेको छ। यद्यपि, धनी तेल क्षेत्रहरू हुँदाहुँदै पनि दक्षिण सुडानमा कुनै पनि तेल शोधन केन्द्र (refinery) छैन, जसका कारण तेल सुडानमा पठाएर प्रशोधन गर्नुपर्ने बाध्यता छ।
स्वतन्त्रतापछि, दक्षिण सुडानले आफ्नो मुद्रा "सुडानी पाउन्ड" बाट "दक्षिण सुडानी पाउन्ड" मा रूपान्तरण गर्यो, जसलाई दक्षिण सुडानको केन्द्रीय बैंक (Central Bank of South Sudan) द्वारा व्यवस्थापन गरिन्छ। यहाँको प्रमुख निर्यात वस्तुहरूमा कच्चा पेट्रोलियम (crude petroleum) र गम अरविक (gum arabic) पर्दछन्, भने प्रमुख आयात वस्तुहरूमा खाद्यान्न, गाडी, मेसिनरी, र अन्य निर्मित सामग्रीहरू छन्। दक्षिण सुडान २०१६ मा पूर्वी अफ्रिकी समुदाय (EAC) मा सामेल भयो र हाल COMESA (Common Market for Eastern and Southern Africa) को पूर्ण सदस्यताको प्रतीक्षा गर्दैछ।
सेवा क्षेत्र अझै प्रारम्भिक चरणमा छ, जसमा मुख्यत: सरकारी कर्मचारीहरू, साना व्यवसाय (जस्तै पसल, रेष्टुरेन्ट) समावेश छन्। पर्यटन उद्योगमा ठूलो सम्भावना भए पनि, हालसम्म यसको विकास सीमित छ।
कृषि क्षेत्र देशको मुख्य रोजगारीको स्रोत हो। तर, सुडानी शासनकालमा ट्रेड युनियनहरू प्रतिबन्धित थिए र स्वतन्त्रतापछि पनि व्यावसायिक श्रमिक संगठनहरू सक्रिय भएका छैनन्। राजस्वको मुख्य स्रोत स्वतन्त्रताअघि खार्तुमसँगको तेल-आधारित सम्झौता बाट प्राप्त भएको थियो।
यातायात पूर्वाधार अत्यन्त अविकसित छ। यहाँ अत्यन्त कम पक्की सडकहरू र सीमित रेल मार्गहरू छन्। सेतो नाइल (White Nile) नदी प्रमुख यातायात मार्ग हो। देशको सबैभन्दा व्यस्त विमानस्थल "जुबा अन्तर्राष्ट्रिय विमानस्थल" (Juba International Airport) हो।
दूरसञ्चार सेवा २००५ पछि विस्तार हुँदै आएको छ, जहाँ मुख्य रूपमा मोबाइल नेटवर्क र शहरी क्षेत्रमा इन्टरनेट सेवा केन्द्रित छन्।